Istraživanje podataka u bioinformatici, šk. 2021/2022.

dr Gordana Pavlović-Lažetić, red. prof.

  • Predavanja: četvrtak, 10-12h, Studentski trg, 844/V
    Predavanja će početi daljinski, korišćenjem Webex platforme. Link na prvo predavanje poslat je na mejl adrese u grupi
  • Program predmeta:
    • Uvod u bioinformatiku
    • Istraživanje podataka - pregled
    • Bioinformatičke baze podataka
    • Genomika - polimorfizam, klasterovanje i klasifikacija
    • Otkrivanje biomarkera
    • Probabilistički generativni i diskriminativni modeli i primene u bioinformatici
    • Proteomika - predviđanje strukture, neuređenosti i funkcije proteina
    • Istraživanje podataka u biološkim mrežama
  • Literatura:
    • Delovi/poglavlja iz:
      • Sumeet Dua, Pradeep Chowriappa: Data Mining for Bioinformatics
      • Darius M. Dziuda: Data Mining for Genomics and Proteomics - Analysis of Gene and Protein Expression Data
      • Phillip Compeau, Pavel Pevzner: Bioinformatics Algorithms: An Active Learning Approach
      • Daphne Koller, Nir Friedman: Probabilistic Graphical Models, Principles and Techniques
    • Izbor radova iz časopisa
    • Materijali sa predavanja
  • Obaveze na kursu:
    • Seminarski zadatak sa prezentacijom 70%
    • Završni ispit 30%